Preview

Медицинская иммунология

Расширенный поиск

Анализ ассоциации полиморфизма генов CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 с уровнем экспрессии гена HSPA1B

https://doi.org/10.15789/1563-0625-AOT-1629

Полный текст:

Аннотация

Белки теплового шока  (HSPs, heatshock proteins) образуют одну из клеточных молекулярных систем, обладающую шаперонной активностью, направленную на стабилизацию структуры внутриклеточных протеинов, обеспечение устойчивости клеток к стрессу, на ренатурацию неправильно свернутых и  элиминацию  денатурированных цитоплазматических белков. Учитывая важную роль нарушений уровня экспрессии HSPs  в патогенезе целого  ряда заболеваний, в нашей работе  был проведен  поиск ассоциации наличия однонуклеотидных замен  (SNPs) в отобранных нами актуальных участках  генома с базальным уровнем транскрипционной активности генов  группы HSPA,  а именно HSPA1A/B, HSPA1A, HSPA1B, HSPA6 и HSPA8 в мононуклеарных лейкоцитах (PBMС) в группе добровольцев из популяции населения средней части  России. Исследование проводили с использованием ДНК и РНК, выделенных из лимфоцитов периферической крови 16 доноров. Генотипирование проводилось методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующим секвенированием ПЦР продукта. Для  оценки уровня экспрессии генов  группы HSPA  проводили синтез кДНК на матрице РНК, выделенной из  образцов клеточных фракций PBMC с последующим проведением полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Было  проведено генотипирование участков, в которых находятся следующие полиморфизмы: rs400547  (A/G), rs1150793  (G/A), rs707936  (A/G), rs707915 (A/T), rs376510 (T/C), находящиеся в генах  CLIC1,  MSH5, C6orf26, MSH5, C6orf25 соответственно. Был  охарактеризован базальный уровень транскрипции генов  конститутивно экспрессирующихся и индуцируемых белков семейства HSP70 и проведен поиск ассоциации их экспрессии с полиморфизмами. Было  обнаружено, что в клетках PBMC генотип AG/AA (SNP rs400547), AG/GG (rs1150793), AG  (rs707936), TA (rs707915), TC  (rs376510)  по  изученным нами участкам ассоциирован  c понижением транскрипции гена  HSPA1B  (p = 0,02),  по сравнению с гомозиготами: GG (SNP rs400547), AA (rs1150793), GG (rs707936), TT  (rs707915), CC  (rs376510). Ассоциации указанных полиморфизмов с экспрессией генов  HSPA1A, HSPA6  и HSPA8  выявлено не было.  Гены  CLIC1,  MSH5, C6orf26, C6orf25, в которых присутствуют изученные нами полиморфизмы, находятся в одном  локусе вблизи гена HSPA1B  на 6-й хромосоме. Обнаруженное нами снижение экспрессии гена HSPA1B  при наличии однонуклеотидных полиморфизмов в близлежащих генах  может  свидетельствовать о пространственных взаимодействиях этого  локуса  и локуса  гена HSPA1B  и о том, что изменение генотипа CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 может повлечь за собой  изменение экспрессии близко расположенных генов, которые являются функционально значимыми для клетки.

Об авторах

Ю. Д. Вавилова
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Россия

Вавилова  Юлия Дмитриевна – техник-лаборант лаборатории клеточных взаимодействий.

140103, Московская обл., г. Раменское, ул. Свободы, 8/140, Teл.: 8 (915) 144-80-12


А. А. Бойко
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Россия

Бойко Анна Александровна – кандидат биологических наук,  научный сотрудник лаборатории клеточных взаимодействий.

Москва


Е. И. Коваленко
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Россия

Коваленко Елена Ивановна – кандидат биологических наук,  старший научный сотрудник лаборатории клеточных взаимодействий.

Москва


М. В. Гречихина
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук Российской академии
Россия

Гречихина Мария Владимировна – младший научный сотрудник лаборатории клеточных взаимодействий.

Москва


О. А. Шустова
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук Российской академии
Россия

Шустова Ольга Александровна – младший научный сотрудник лаборатории клеточных взаимодействий.

Москва


Т. Л. Ажикина
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук Российской академии
Россия

Ажикина Татьяна Леодоровна – доктор биологических наук, руководитель лаборатории регуляторной транскриптомики.

Москва


А. М. Сапожников
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Россия

Сапожников     Александр Михайлович – доктор биологических наук, профессор, руководитель лаборатории клеточных взаимодействий.

Москва


Список литературы

1. Alfirevic A., Mills T., Harrington P., Pinel T., Sherwood J., Jawaid A., Smith J.C., March R.E., Barratt B.J., Chadwick D.W., Kevin Park B., Pirmohamed M. Serious carbamazepine-induced hypersensitivity reactions associated with the HSP70 gene cluster. Pharmacogenet. Genomics, 2006, Vol. 16, no. 4, pp. 287-296.

2. Bogunia-Kubik K., Koscinska K., Suchnicki K., Lange A. HSP70-hom gene single nucleotide (+2763 G/A and +2437 C/T) polymorphisms in sarcoidosis. Int. J. Immunogenet., 2006, Vol. 33, no. 2, pp. 135-140.

3. Boyko A.A., Azhikina T.L., Streltsova M.A., Sapozhnikov A.M., Kovalenko E.I. HSP70 in human polymorphonuclear and mononuclear leukocytes: comparison of the protein content and transcriptional activity of HSPA genes. Cell Stress Chaperones, 2017, Vol. 22, no. 1, pp. 67-76.

4. Helmbrecht K., Zeise E., Rensing L. Chaperones in cell cycle regulation and mitogenic signal transduction: a review. Cell Proliferation, 2000, Vol. 33, no. 6, pp. 341-365.

5. Kampinga H.H., Hageman J., Vos M.J., Kubota H., Tanguay R.M., Bruford E.A., Cheetham M.E., Chen B., Hightower L.E. Guidelines for the nomenclature of the human heat shock proteins. Cell Stress Chaperones, 2009, Vol. 14, no. 1, pp. 105-111.

6. Kee C., Cheong K.Y., Pham K., Waterer G.W., Temple S.E. Genetic variation in heat shock protein 70 is associated with septic shock: Narrowing the association to a specific haplotype. Int. J. Immunogenet., 2008, Vol. 35, no. 6, pp. 465-473.

7. Martin A.M., Nolan D., Gaudieri S., Almeida C.A., Nolan R., James I., Carvalho F., Phillips E., Christiansen F.T., Purcell A.W., McCluskey J., Mallal S. Predisposition to abacavir hypersensitivity conferred by HLA-B*5701 and a haplotypic Hsp70-Hom variant. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, Vol. 101, no. 12, pp. 4180-4185.

8. Maugeri N., Radhakrishnan J., Knight J.C. Genetic determinants of HSP70 gene expression following heat shock. Hum. Mol. Genet., 2010, Vol. 19, no. 24, pp. 4939-4947.

9. Shibata T., Arisawa T., Tahara T., Yoshioka D., Maruyama N., Fujita H., Kamiya Y., Nakamura M., Nagasaka M., Iwata M., Takahama K., Watanabe M., Hirata I., Nakano H. Protective role of genetic polymorphism of heat shock protein 70-2 for gastric cancer risk. Dig. Dis. Sci., 2009, Vol. 54, no. 1, pp. 70-74.

10. Spagnolo P., Sato H., Marshall S.E., Antoniou K.M., Ahmad T., Wells A.U., Ahad M.A., Lightman S., du Bois R.M., Welsh K.I. Association between heat shock protein 70/Hom genetic polymorphisms and uveitis in patients with sarcoidosis. Investig. Ophthalmol. Vis. Sci., 2007, Vol. 48, no. 7, pp. 3019-3025.

11. Temple S.E.L., Cheong K.Y., Ardlie K.G., Sayer D., Waterer G.W. The septic shock associated HSPA1B1267 polymorphism influences production of HSPA1A and HSPA1B. Intensive Care Med., 2004, Vol. 30, no. 9, pp. 1761-1767.

12. Ucisik-Akkaya E., Davis C.F., Gorodezky C., Alaez C., Dorak M.T. HLA complex-linked heat shock protein genes and childhood acute lymphoblastic leukemia susceptibility. Cell Stress Chaperones, 2010, Vol. 15, no. 5, pp. 475-485.


Дополнительные файлы

1. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (15KB)    
Метаданные
2. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (54KB)    
Метаданные
3. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (25KB)    
Метаданные
4. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (12KB)    
Метаданные
5. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (13KB)    
Метаданные
6. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (13KB)    
Метаданные
7. Неозаглавлен
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Метаданные

Для цитирования:


Вавилова Ю.Д., Бойко А.А., Коваленко Е.И., Гречихина М.В., Шустова О.А., Ажикина Т.Л., Сапожников А.М. Анализ ассоциации полиморфизма генов CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 с уровнем экспрессии гена HSPA1B. Медицинская иммунология. 2020;22(4):779-784. https://doi.org/10.15789/1563-0625-AOT-1629

For citation:


Vavilovа Yu.D., Boyko A.A., Kovalenko E.I., Grechikhina M.V., Shustova O.A., Azhikina T.L., Sapozhnikov A.M. Analysis of the association of the polymorphism of the CLIC1, MSH5, C6orf26, C6orf25 genes with the expression level of the HSPA1B gene. Medical Immunology (Russia). 2020;22(4):779-784. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/1563-0625-AOT-1629

Просмотров: 138


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1563-0625 (Print)
ISSN 2313-741X (Online)