ASSOCIATIONS OF INTERFERON GENE POLYMORPHISMS OAS-1, OAS-3, PKR WITH CHRONIC VIRAL HEPATITIS C
https://doi.org/10.15789/1563-0625-2011-1-93-100
Abstract
Abstract. Present work is devoted to analyzing possible associations of single-nucleotide gene polymorphisms (SNPs) with liver pathology in patients with chronic hepatitis C. SNP genotypes and allele frequencies were identified for some genes of interferon system, i.e., oligoadenilatsynthetase-1 (-1A/G), oligoadenilatsynthetase-3 (+1314C/T), and protein kinase R (+244A/G), using DNA samples from healthy donors and patients with chronic hepatitis C representing population of Tomsk and Tomsk Region. An association has been shown between SNPs of oligoadenilatsynthetase-1 and protein kinase R genes, and clinical activity of inflammatory process in the liver, as well as an impact of certain SNPs of protein kinase R and oligoadenilatsynthetase-3 genes upon fibrogenesis. (Med. Immunol., 2011, vol. 13, N 1, pp 93-100)
About the Authors
V. A. Bychkov
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
N. V. Ryazantseva
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
V. V. Novitskiy
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
N. A. Semenova
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
L. A. Kleptsova
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
V. D. Yakushina
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства
по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Антошина В.В., Дортман В.В., Коненков В.И., Белобородова Е.В., Наследникова И.О., Новицкий В.В. Прогноз предрасположенности человека к развитию вирусного гепатита C по полиморфизмам генов цитокинов G-308A TNFA, T-330G IL-2, C-590T IL-4, C-703T IL-5 и C-592A IL-10 // Медицинская иммунология. – 2006. –Т. 8, № 5-6. – С. 715-720.
2. Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И. Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита // Вестник Вавиловского общества генетиков и селекционеров. – 2006. – Т. 10, № 3. – С. 565-571.
3. Боровиков В.В. Statistica. Искусство анализа данных на компьютере. – М., 2001. – 360 с.
4. Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Геномные основы подверженности к инфекционным заболеванием // Вестник Вавиловского общества генетиков и селекционеров. –2006. – Т. 10, № 3. – С. 540-549.
5. Ивашкин В.Т. Клеточная и молекулярная биология воспаления печени // Росc. журн. гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. – 1998. –№ 5. – С. 13-17.
6. Наследникова И.О., Белобородова Е.В., Рязанцева Н.В., Белобородова Э.И., Новицкий В.В., Черногорюк Г.Э. Иммунорегуляторные цитокины и хронизация вирусного гепатита С: Клинико-иммунологические параллели // Клиническая медицина. – 2005. – № 9. – С. 20-25.
7. Онищенко Г. Г. Эпидемическая ситуация в Российской Федерации и меры по ее стабилизации // Проблемы туберкулеза. – 2003. – № 11. –С. 4-9.
8. Рязанцева Н.В., Жукова О.Б., Белобородова Э.И., Новицкий В.В., Ткаченко С.Б., Белобородова Е.В., Токарева Н.В., Чечина О.Е., Михеев С.Л. Изменения цитогенетического статуса лимфоцитов периферической крови при хронических HBV- и HCV-инфекциях //Росc. журн.гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. – 2004. – Т. 14, № 1. – С. 37-40.
9. Симбирцев А.С., Громова А.Ю. Функциональный полиморфизм генов регуляторных молекул воспаления // Цитокины и воспаление. – 2005. – № 1. – С. 3-11.
10. Cookson W.O., Moffatt M.F. The genetics of specific allergy // Monogr. Allergy. – 1996. – Vol. 33. – P. 71-96.
11. Glass W.G., McDermott D.H., Lim J.K. CCR5 deficiency increases risk of symptomatic West Nile virus infection // J. Exptl Med. – 2006. – Vol. 203, N 1. – P. 35-40.
12. Hovnanian A., Rebouillat D., Mattei M.G. The human 2′,5′-oligoadenylate synthetase locus is composed of three distinct genes clustered on chromosome 12q24.2 encoding the 100-, 69- and 40-kDa forms //Genomics. – 1998. – Vol. 52, N 3. – P. 267-277.
13. Knapp S., Yee L.J., Frodsham A.J. Polymorphisms in interferon-induced genes and the outcome of hepatitis С virus infection: roles of MxA, OAS-1 and PKR //Genes and Immunity. – 2003. – Vol. 4, N 6. – P. 411-419.
14. Pawlotsky J.M., Hovanessian A.G. Effect of alpha interferon (IFN-alpha) on 2′-5′-oligoadenylate synthetase activity in peripheral blood mononuclear cells of patients with chronic hepatitis C: relationship to the antiviral effect of IFN-alpha // Antimicrob. Agents. Chemother. – 1996. – Vol. 40, N 2. – P. 320-324.
15. Richardson M.M., Powell E.E., Barrie H.D., Clouston A.D., Purdie D.M. and Jonsson J.R. A combination of genetic polymorphisms increases the risk of progressive disease in chronic hepatitis C //Genetics. – 2005. – Vol. 42. – P. 45-47.
16. Samson M., Libert F., Doranz B.J. Resistance to HIV-1 infection in Caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene //Nature. – 1996. – Vol. 382. – P. 722-725.
17. Takizawa T., Ohashi K., Nakanishi Y. Possible involvement of double-stranded RNA-activated protein kinase in cell death by influenza virus infection // Virol. – 1996. – Vol. 70, N 11. – P. 8128-8132.
18. Terada T., Ueyama J., Ukita Y., Ohta T. Protein expression of double-stranded RNAactivated protein kinase (PKR) in intrahepatic bile ducts in normal adult livers, fetal livers, primary biliary cirrhosis, hepatolithiasis and intrahepatic cholangiocarcinoma // Liver. – 2000. – Vol. 20, N 6. – P. 450-457.
19. Yakub I., Lillibridge K.M., Moran A. Single nucleotide polymorphisms in genes for 2′-5′-oligoadenylate synthetase and RNase L in patients hospitalized with West Nile virus infection // J. Inf. Diseases. – 2005. – Vol. 192, N 10. – P. 1741-1748.
Review
For citations:
Bychkov V.A., Ryazantseva N.V., Novitskiy V.V., Semenova N.A., Kleptsova L.A., Yakushina V.D. ASSOCIATIONS OF INTERFERON GENE POLYMORPHISMS OAS-1, OAS-3, PKR WITH CHRONIC VIRAL HEPATITIS C. Medical Immunology (Russia). 2011;13(1):93-100. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/1563-0625-2011-1-93-100
Views:
1007
Email this article 