КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА В ПРОМОТОРНЫХ УЧАСТКАХ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL-1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL-4 C-590T И IL-10 C-592α В ПРОГНОЗЕ ЭФФЕКТА ОТ ЛЕЧЕНИЯ РЕВМАТОИДНОГО АРТРИТА
https://doi.org/10.15789/1563-0625-2010-4-5-361-374
Аннотация
В статье приводятся результаты комплексного анализа частот встречаемости большого числа сочетаний генотипов в трех-, четырех-, пяти- и шестилокусных комбинациях аллельных вариантов генов цитокинов IL-1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL-4 C-590T и IL-10 C-592A среди 104 пациентов с ревматоидным артритом, получавших базисную терапию с применением метотрексата. Показана зависимость эффекта терапии, определяемого по снижению индекса DAS28 к 24 неделям от начала лечения, от исследованных генетических комбинаций в геноме пациента. Выявлена связь интенсивности развития лекарственных осложнений с «цитокиновым генотипом» пациента. Проводится анализ полученных результатов в связи с имеющимися данными об ассоциированности уровня продукции провоспалительных и антивоспалительных цитокинов с полиморфизмом промоторных участков их генов. Предполагается, что при дальнейших клинических исследованиях полученные результаты могут быть использованы в качестве фармакогенетических критериев выбора максимально эффективной индивидуализированной терапии с учетом генотипа пациента с ревматоидным артритом.
Об авторах
В. И. Коненков
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
В. Ф. Прокофьев
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
А. В. Шевченко
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
О. В. Голованова
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
Е. В. Зонова
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
М. А. Королев
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
Ю. Б. Леонова
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии Сибирского отделения РАМН, лаборатория клинической иммуногенетики, г. Новосибирск
Россия
Россия
Список литературы
1. Вейр Б. Анализ генетических данных: Дискретные генетические признаки: пер. с англ. -М.: Мир, 1995. -400 с.
2. Власов В.В. Эффективность диагностических исследований. -М.: Медицина, 1988. -245 с.
3. Гланц С. Медико-биологическая статистика: пер. с англ. -М.: Практика, 1998. -459 с.
4. Губарь Е.Е., Бочкова А.Г., Бунчук Н.В. Сравнительная эффективность и переносимость тройной базисной терапии (метотрексат + сульфасалазин + гидроксихлорохин) с монотерапией метотрексатом у больных ревматоидным артритом (предварительные результаты)//Тер. архив. -2008. -№ 5. -С. 25-30.
5. Гублер Е.В. Вычислительные методы анализа и распознавания патологических процессов. -Л.: Медицина, 1983. -296 с.
6. Коненков В.И. Медицинская и экологическая иммуногенетика. -СО РАМН, Новосибирск, 1999. -250 с.
7. Ластед Л.Б. Введение в проблему принятия решений в медицине. -М.: Мир, 1971. -282 с.
8. Насонов Е.Л. Иммунопатология ревматических заболеваний//Инновационные технологии в диагностике и лечении ревматических заболеваний: Лекции цикла повышения квалификации врачей. -Москва, 2009. -С. 4-10.
9. Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ Statistica. -М.: Медиасфера, 2002. -312 с.
10. Смольникова М.В., Соловьева И.Г., Коненкова Л.П., Сизиков А.Э., Герцог О.А., Кожевников В.С., Коненков В.И. Распределение аллельных вариантов генов цитокинов (TNFA и IL-10) у больных ревматоидным артритом европеоидов//Медицинская иммунология. -2007. -Т. 9, № 2-3. -С. 204-205.
11. Фишер Р.А. Статистические методы для исследователей. -М.: Госстатиздат, 1958. -268 с.
12. Юнкеров В.И., Григорьев С.Г. Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований. -СПб.: ВМедА, 2002. -266 с.
13. Asghar T., Yoshida S., Kennedy S., Negoro K., Zhuo W., Hamana S., Motoyama S., Nakago S., Barlow D., Maruo T. The tumor necrosis factor-alpha promoter -1031 C polymorphism is associated with decreased risk of endometriosis in a Japanese population//Human Reproduction. -2004. -Vol. 19, N 11. -P. 2509-2514.
14. Choi E., Lee H.J., Yoo T., Chanock S. A common haplotype of interleukin-4 gene IL-4 is associated with severe respiratory syncytial virus disease in Korean children//The Journal of Infectious Diseases. -2002. -Vol. 186. -P. 1207-1211.
15. Coenen M.J., Toonen E.J., Scheffer H., Radstake T.R., Barrera P., Franke B. Pharmacogenetics of anti-TNF treatment in patients with rheumatoid arthritis//Pharmacogenomics. -2007. -N 8. -P. 761-773.
16. Combe B. Early rheumatoid arthritis: strategies for prevention and management//Best Pract. Res. Clin. Rheumatol. -2007. -Vol. 21, N 1. -P. 27-42.
17. Dieude P., Cornelis F. Genetic basis of rheumatoid arthritis//Jt. Bone Spine. -2005. -Vol. 9. -P. 3-7.
18. Fernandez-Real J.M., Vendrell J., Richart C., Gutierrez C., Ricart W. Platelet count and Interleukin 6 Gene polymorphism in healthy subjects//BMC Medical Genetics. -2001. -Vol. 2, N 6. -P. 1471-2350.
19. Fleischman R.M. Is there a need for new therapies for rheumatoid arthritis//J. Rheumatol. -2005. -Vol 73, N 32. -Р. 3-7.
20. Fransen J., Creemers M.C., Van Riel P.L. Remission in rheumatoid arthritis: agreement of the disease activity score (DAS28) with the ARA preliminary remission criteria//Rheumatology (Oxford). -2004. -N 43. -Р. 1252-1255.
21. Goldblatt F., Isenberg D.A. New therapy for rheumatoid arthritis//Clin. Exp. Immunol. -2005. -N 140. -Р. 195-204.
22. Haukim N., Bidwell J.L., Smith A.J.P., Keen L.J., Gallagher G., Kimberly R., Huizinga T., McDermott M.F., Oksenberg J., McNicholl J., Pociot F., Hardt C., D'Alfonso S. Cytokine gene polymorphism in human disease:on-line databases//Genes and Immunity. -2002. -Vol. 3, N 6. -P. 313-330.
23. John S., Myerscough A., Marlow A., Hajeer A., Silman A., Ollier W., Worthington J. Linkage of cytokine genes to rheumatoid arthritis. Evidence of genetic heterogeneity // Ann. Rheum. Dis. - 1998. - Vol. 57, N 6. - P. 361-365.
24. Li H.Q., Li Z., Liu Y., Li J.H., Dong J.Q., Gao J.R., Gou C.Y., Li H. Association of polymorphism of tumor necrosis factor-alpha gene promoter region with outcome of hepatitis B virus infection // World J. Gastroenterol. - 2005. - Vol. 11, N 33. - P. 5213-5217.
25. Mehta C.R., Patel N.R., Gray R. On computing an exact confidence interval for the common odds ratio in several 2 x 2 contingency tables//JASA. -1985. -Vol. 80. -P. 969-973.
26. Mock C.C., Lanchbury J.S., Chan D.W., Lau C.S. Interleukin-10 promoter polymorphisms in Southern Chinese patients with systemic lupus erythematosus//Arthritis Rheum. -1998. -Vol. 41. -P. 1090-1095.
27. O'Dell J.R., Leff R., Paulsen G., Yaire C. Treatment of rheumatoid arthritis with methotrexate and hydroxychloroquine, methotrexate and sulfasalazine, or a combination of three medications//Arthr. And Rheum. -2002. -Vol. 46. -P. 1164-1170.
28. O'Rielly D.D., Roslin N.M., Beyene J., Pope A., Rahman P. TNF-alpha-308 G/A polymorphism and responsiveness to TNF-alpha blockade therapy in moderate to severe rheumatoid arthritis: a systematic review and meta-analysis//Pharmacogenomics J. -2009. -N 9. -P. 161-167.
29. Pascual M., Nieto A., Mataran L., Balsa A., Pascual-Salcedo D., Martn J. IL-6 promoter polymorphisms in rheumatoid arthritis//Genes and Immunity. -2000.-N 1. -P. 338-340.
30. Patino-Garcia A., Sotillo-Pineiro E., Modesto C., Sierrasesumaga L. Screening of the human tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) gene promoter polymorphisms by PCR-DGGE analysis//Mutation Research. -1999. -Vol. 406. -P. 121-125.
31. Pincus T., Yazici Y., Sokka T., Alehata D., Smolen J.S. Methotrexate as the "anchor drug" for the treatment of early rheumatoid arthritis//Clin. Exp. Rheumatol. -2003. -Vol. 21, N 31. -P. 179-185.
32. Quinn M.A., Conaghan P.G., Emery P. The therapeutic approach of early intervention for rheumatoid arthritis: what is the evidence?//Rheumatology (Oxford). -2001. -N 40. -Р. 1211-1220.
33. Ranganathan P. An Update on Methotrexate Pharmacogenetics in Rheumatoid Arthritis//Pharmacogenomics. -2008. -Vol. 4, N 9. -P. 439-451.
34. Seitz M., Wirthmller U., Mller B., Villiger P.M. The -308 tumour necrosis factor-alpha gene polymorphism predicts therapeutic response to TNFalpha-blockers in rheumatoid arthritis and spondyloarthritis patients//Rheumatology (Oxford). -2007. -N 46. -P. 93-96.
35. Steinbrocker O., Traeger C.N. Therapeutic criteria in rheumatoid arthritis//J. Am. Med. Association. -1949. -Vol 8, N 40. -Р. 659-662.
36. Warl M.C., Farhan A., Metselaar H.J., Hop W.C., Perrey C., Zondervan P.E., Kap M., Kwekkeboom J., Ijzermans J.N., Tilanus H.W., Pravica V., Hutchinson I.V., Bouma G.J. Are Cytokine Gene Polymorphisms Related to in vitro cytokine production profiles?//Liver Transplantation. -2003. -Vol. 9, N 2. -P. 170-181.
37. Wessels J. A. M., de Vries-Bouwstra J.K., Heijmans B.T., Slagboom P.E., Methotrexate in Early Rheumatoid Arthritis Are Associated With Single-Nucleotide Polymorphisms in Genes Coding for Folate Pathway Enzymes//Arthritis & Rheumatism. -2006. -Vol. 54, N 4. -P. 1087-1095.
38. Zhang D., Zheng H., Zhou Y., Tang X., Yu B., Li J. Association of IL-1beta gene polymorphism with cachexia from locally advanced gastric cancer//BMC Cancer. -2007. -Vol. 7, N 45. -P. 45-51.
Рецензия
Для цитирования:
Коненков В.И., Прокофьев В.Ф., Шевченко А.В., Голованова О.В., Зонова Е.В., Королев М.А., Леонова Ю.Б. КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА В ПРОМОТОРНЫХ УЧАСТКАХ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL-1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL-4 C-590T И IL-10 C-592α В ПРОГНОЗЕ ЭФФЕКТА ОТ ЛЕЧЕНИЯ РЕВМАТОИДНОГО АРТРИТА. Медицинская иммунология. 2010;12(4-5):361-374. https://doi.org/10.15789/1563-0625-2010-4-5-361-374
For citation:
Konenkov V.I., Prokof’ev V.F., Shevchenko A.V., Golovanova O.V., Zonova E.V., Korolev M.A., Leonova J.B. COMBINATION ANALYSIS OF CYTOKINE GENE PROMOTER POLYMORPHISMS OF IL1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL4 C-590T, IL-10 C-592A FOR PREDICTION OF TREATMENT EFFICIENCY IN RHEUMATOID ARTHRITIS. Medical Immunology (Russia). 2010;12(4-5):361-374. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/1563-0625-2010-4-5-361-374
Просмотров:
1016
Послать статью по эл. почте 