Preview

Медицинская иммунология

Расширенный поиск

МЕЖГЕННЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL1, IL1RA, IL6, IL10 И TNFА У БОЛЬНЫХ СИНДРОМОМ РАЗДРАЖЕННОГО КИШЕЧНИКА И НЕСПЕЦИФИЧЕСКИМ ЯЗВЕННЫМ КОЛИТОМ РУССКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

https://doi.org/10.15789/1563-0625-2018-6-921-926

Аннотация

В основе развития мультифакторных заболеваний (неспецифический язвенный колит и синдром раздраженного кишечника) лежат сложные межгенные взаимодействия, которые необходимо учитывать при прогнозировании риска развития неблагоприятного течения патологического процесса. Индивидуальные генетические полиморфизмы являются слабым фактором риска развития болезни и не могут быть использованы в качестве прогностической модели развития мультифакторных патологий, особенно в случаях редких аллелей. Но хорошо известно, что опасным является сочетание неблагоприятных аллелей нескольких генов с аддитивным эффектом, поэтому идентификации таких полиморфизмов придается большое значение. Ранее нами был проведен комплекс исследований по оценке ассоциации аллелей и генотипов генов цитокинов IL1β, TNFα, IL1rа, IL10, IL6 с предрасположенностью/устойчивостью к неспецифическому язвенному колиту и синдрому раздраженного кишечника у русских Челябинской области, в ходе которого установлены особенности распределения аллелей и генотипов данных генов при НЯК и СРК. В исследовании использовались следующие методы: выделение образцов ДНК из цельной крови, проведение генотипирования исследуемых полиморфизмов генов с помощью ПЦР, ПДРФ. В продолжение был проведен сравнительный анализ межгенных взаимодействий генов цитокинов IL1β, TNFα, IL1rа, IL10, IL6 с использованием метода сокращения многофакторной размерности у больных синдромом раздраженного кишечника и неспецифическим язвенным колитом. Анализ основан на использовании комбинации полиморфных локусов генов IL1β, TNFα, IL1rа, IL10, IL6, выбранных для анализа межгенных взаимодействий, в отношении риска развития предрасположенности к СРК и НЯК. В результате исследования для СРК была установлена четырехлокусная модель IL1β(+3953)*Т/TNFα(-308)*A/IL10(-1082)*G/IL6(-174)*G, которая характеризовалась 90% воспроизводимостью и точностью предсказания 74,53%. Данная модель генных взаимодействий между генами цитокинов IL1β, TNFα, IL1rа, IL10, IL6 при СРК имела наибольший потенциал предикции (p < 0,001), в то время как модель для НЯК не имела статистической значимости. Установлены следующие виды взаимодействий: синергичное взаимодействие между генами IL1β(+3953)*Т и TNFα(-308)*A, в то время как IL6(-174)*G и IL10(-1082)*G, TNFα(-308)*A находятся в антагонистических взаимоотношениях. Проведенное исследование позволило установить, что из полиморфных вариантов генов полиморфизм -174 G/C IL-6 может играть центральную роль и формировать межгенные взаимодействия с SNPs IL1β, TNFα, IL10 в реализации предрасположенности к синдрому раздраженного кишечника у русских Челябинской области.

Об авторах

Д. С. Сташкевич
ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»
Россия

к.б.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии

454021, Россия, г. Челябинск, ул. Молдавская, 25-15.
Тел.: 8 (351) 799-71-54



С. В. Беляева
ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»
Россия

к.б.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии



Ю. Ю. Филиппова
ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»
Россия

к.б.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии



А. Л. Бурмистрова
ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»
Россия

д.м.н., профессор, декан биологического факультета



Список литературы

1. Генетический паспорт – основа индивидуальной и предиктовой медицины / Под ред. В.С. Баранова. СПб.: Изд-во Н-Л, 2009. 528 с. [Genetic passport – the basis of individual and predictive medicine / Ed. V.S. Baranov]. St. Petersburg: Publishing House of N-L, 2009. 528 p.

2. Колчанов Н.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г. Генные сети // Вавиловский журнал генетики и селекции, 2013. Т. 17, № 4/2. С. 833-850. [Kolchanov N.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Likhoshvai V.A., Matushkin Yu.G. Gene networks. Vavilovskiy zhurnal genetiki i selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding, 2013, Vol. 17, no. 4/2, pp. 833-850. (In Russ.)]

3. Силивончик Н.Н., Пиманов С.И. Синдром раздраженного кишечника (по материалам Римского IV консенсуса по функциональным пищеварительным расстройствам) // Лечебное дело: научно-практический терапевтический журнал, 2017. № 3 (55). С. 23-29. [Silivonchik N.N., Pimanov S.I. Irritable bowel syndrome (of the Rome IV consensus for functional gastrointestinal disorders). Lechebnoe delo: nauchno-prakticheskiy terapevticheskiy zhurnal = Medical Case: Scientific and Practical Therapeutic Journal, 2017, no. 3 (55), pp. 23-29. (In Russ.)]

4. Сташкевич Д.С., Бурмистрова А.Л., Кобеляцкая А.А. Полиморфизм генов провоспалительных цитокинов IL-1B, IL-6, TNFA у больных неспецифическим язвенным колитом русской популяции Челябинской области // Современные проблемы науки и образования (Электронный журнал), 2016. № 4. [Stashkevich D.S., Burmistrova A.L., Kobelyatskaya A.A. Polymorphism of the genes of the proinflammatory cytokines IL-1B, IL-6, TNFA in patients with ulcerative colitis of the Russian population of the Chelyabinsk region. Sovremennye problemy nauki i obrazovaniya (Elektronnyy zhurnal) = Modern Problems of Science and Education, 2016, no. 4. (In Russ.)]

5. Barkhordari E, Rezaei N., Ansaripour B., Larki P., Alighardashi M., Ahmadi-Ashtiani H.R., Mahmoudi M., Keramati M.-R., Habibollahi P., Bashashati M., Ebrahimi-Daryani N., Amirzargar A.A. Proinflammatory cytokine gene polymorphisms in irritable bowel syndrome. J. Clin. Immunol., 2010, Vol. 30, pp. 74-79.

6. Basso P.J., Fonseca M.T.C., Bonfa G., Alves V.B.F., Sales-Campos H., Nardini V., Cardoso C.R.B. Association among genetic predisposition, gut microbiota, and host immune response in the etiopathogenesis of inflammatory bowel disease. Braz. J. Med. Biol. Res., 2014, Vol. 47, pp. 727-737.

7. Hahn L.W., Ritchie M.D., Moore J.H. Multifactor dimensionality reduction software for detecting gene–gene and gene-environment interactions. Bioinformatics, 2003, Vol. 19, pp 376-382.

8. Qin S.-Y., Jiang H.-X., Lu D.-H., Zhou Y. Association of interleukin-10 polymorphisms with risk of irritable bowel syndrome: A meta-analysis. World J. Gastroenterol., 2013, Vol. 19, pp. 9472-9480.

9. Stankovic B., Dragasevic S., Popovic D., Zukic B., Kotur N., Sokic-Milutinovic A., Alempijevic T., Lukic S., Milosavljevic T., Nikcevic G., Pavlovic S. Variations in inflammatory genes as molecular markers for prediction of inflammatory bowel disease occurrence. J. Dig. Dis., 2015, Vol. 16, pp. 723-733.

10. Tanaka T., Kishimoto T. Targeting interleukin-6: all the way to treat autoimmune and inflammatory diseases. Int. J. Biol. Sci., 2012, Vol. 8, pp. 1227-1236.


Рецензия

Для цитирования:


Сташкевич Д.С., Беляева С.В., Филиппова Ю.Ю., Бурмистрова А.Л. МЕЖГЕННЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL1, IL1RA, IL6, IL10 И TNFА У БОЛЬНЫХ СИНДРОМОМ РАЗДРАЖЕННОГО КИШЕЧНИКА И НЕСПЕЦИФИЧЕСКИМ ЯЗВЕННЫМ КОЛИТОМ РУССКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ. Медицинская иммунология. 2018;20(6):921-926. https://doi.org/10.15789/1563-0625-2018-6-921-926

For citation:


Stashkevich D.S., Belyaeva S.V., Filippova Yu.Yu., Burmistrova A.L. INTERGENIC INTERACTIONS OF CYTOKINE GENES IL1, IL1RA, IL6, IL10 AND TNFА IN PATIENTS WITH IRRITABLE BOWEL SYNDROME AND ULCERATIVE COLITIS IN RUSSIAN POPULATION OF THE CHELYABINSK REGION. Medical Immunology (Russia). 2018;20(6):921-926. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/1563-0625-2018-6-921-926

Просмотров: 741


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1563-0625 (Print)
ISSN 2313-741X (Online)