mimmunМедицинская иммунологияMedical Immunology (Russia)1563-06252313-741XSPb RAACI10.15789/1563-0625-COD-2640mimmun-2640Research ArticleИММУНОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫIMMUNOLOGICAL METHODSСопоставление разных методов оценки клеточного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2Comparison of different techniques for evaluation of cellular immunity to SARS-CoV-2 virusАфридоноваЗ. Э.AfridonovaZ. E.

Аспирант лаборатории цитокинов.

Москва

Postgraduate Student, Laboratory of Cytokines, G. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and Microbiology.

Moscow

zuafrid@gmail.comТоптыгинаА. П.ToptyginaA. P.

Топтыгина Анна Павловна – доктор медицинских наук, главный научный сотрудник, руководитель лаборатории цитокинов ФБУН «МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского» Роспотребнадзора; профессор кафедры иммунологии ФГБОУ ВО «МГУ им. М.В. Ломоносова».

25212, Москва, ул. Адмирала Макарова, 10

Тел.: 8 (495) 452-18-01; Факс: 8 (495) 452-18-30

Anna P. Toptygina - PhD, MD (Medicine), Chief Research Associate, Head, Laboratory of Cytokines, G. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and Microbiology; Professor, Department of Immunology, Faculty of Biology, Lomonosov Moscow State University.

10 Adm. Makarov St 125212

Phone: +7 (495) 452-18-01; Fax: +7 (495) 452-18-30

toptyginaanna@rambler.ruБоголюбоваА. В.BogolyubovaA. V.

Кандидат биологических наук, заведующая лабораторией трансплантационной иммунологии.

Москва

PhD (Biology), Head, Laboratory of Transplantation Immunology, National Research Center for Hematology.

Moscow

apollinariya.bogolyubova@gmail.comСемикинаЕ. Л.SemikinaE. L.

Доктор медицинских наук, главный научный сотрудник, заведующая лабораторным отделом ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» МЗ РФ; профессор кафедры педиатрии и детской ревматологии ФГАОУ ВО «ПМГМУ им. И.М. Сеченова» МЗ РФ.

Москва

PhD, MD (Medicine), Chief Research Associate, Head of Laboratory Department, National Medical Research Center of Children’s Health; Professor, Department of Pediatrics and Pediatric Rheumatology, I. Sechenov First Moscow State Medical University.

Moscow

semikinaelena@yandex.ruФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского» РоспотребнадзораРоссияG. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationФБУН «Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского» Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова»РоссияG. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and Microbiology; Lomonosov Moscow State UniversityRussian FederationФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения РФРоссияNational Research Center for HematologyRussian FederationФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр здоровья детей» Министерства здравоохранения РФ; ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова» Министерства здравоохранения РФРоссияNational Medical Research Center of Children’s Health; I. Sechenov First Moscow State Medical UniversityRussian Federation20230706202325614311440Copyright © Афридонова З.Э., Топтыгина А.П., Боголюбова А.В., Семикина Е.Л., 20232023Афридонова З.Э., Топтыгина А.П., Боголюбова А.В., Семикина Е.Л.Afridonova Z.E., Toptygina A.P., Bogolyubova A.V., Semikina E.L.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/2640

Большинство методов оценки Т-клеточного иммунитета трудоемки и непригодны для рутинной лабораторной диагностики. Это стимулирует исследователей к созданию доступных и воспроизводимых тестов. Цель исследования – сопоставление трех методов оценки уровня клеточного иммунного ответа на антигены вируса SARS-CoV-2 у переболевших и привитых от новой коронавирусной инфекции. Обследованы: 26 человек, перенесших COVID-19 в легкой или среднетяжелой форме (группа 1), 19 человек, дважды привитых «Спутником V», не болевших COVID-19 (группа 2), 21 человек, перенесший COVID-19 и дважды вакцинированных «Спутником V» (группа 3) и 14 человек, дважды перенесших COVID-19 (группа 4). Мононуклеары периферической крови выделяли градиентным центрифугированием. При оценке первым методом мононуклеары инкубированы с S-белком вируса SARS-CoV-2, окрашивали флуоресцентно мечеными антителами, затем на проточном цитометре BD FACS Canto II подсчитывали процент CD8highCD107a+. При оценке методом ELISpot на наборе Human IFN-γ ELISpot продукцию IFNγ стимулировали S-белком SARS-CoV-2, или смесью пептидов белков SARS-CoV-2 на наборе Corona-T-test. По уровню экспрессии CD107a на CD8high в группах 1, 2, 3 и 4 и количеству продуцентов IFNγ на S-белок вируса SARS-CoV-2 на наборе Human IFN-γ ELISpot значимых различий не обнаружено. Продукция IFNγ группы 3 (гибридный иммунитет) значимо ниже (317,29±19,04 пг/мл) групп 1 и 2 (постинфекционный и поствакцинальный иммунитет) 454,95±20,32 и 470,77±26,24 пг/мл. Относительный уровень IFNγ-продуцирующих клеток в группе 2 был выше (22,34±3,77) против 16,83±2,35 в группе 1 и 15,46±1,83 в группе 3, относительный уровень продукции IFNγ в этих группах не различался. Стимуляция полноразмерным S-белком обнаружила значимое снижение количества пятен в группе 4 (прорывной иммунитет) 30,59±2,29 против 58,97±4,47 в группе 3, а стимуляция смесью пептидов SARS-CoV-2 в группе 4 по сравнению с группой 3 выявила значимое повышение количества IFNγ-продуцирующих клеток 86,72±7,20 против 69,38±5,53 и продукции IFNγ 991,25±65,18 пг/мл против 760,76±50,70 пг/мл и в относительном выражении, 10,30±2,77 против 8,61±2,66 и 68,10±9,41 против 48,35±8,15 соответственно. Результаты трех методов оценки клеточного иммунного ответа положительно, но с разной силой коррелируют между собой.

Most techniques for evaluation of T-cell immunity are laborious and unsuitable for routine laboratory diagnostics, thus encouraging researchers to look for accessible and reproducible tests. The purpose of our study is to compare three methods aimed for evaluation of cellular immune response levels to the SARS-CoV-2 viral antigens in patients who have been ill and vaccinated against a new coronavirus infection. We have examined 26 persons who experienced mild or moderate COVID-19 (group 1); 19 people vaccinated twice with Sputnik V, who did not have clinical COVID-19 (group 2); 21 subjects who had COVID-19 and were twice vaccinated with Sputnik V (group 3), and 14 persons who had COVID-19 twice (group 4). Peripheral blood mononuclear cells were isolated by gradient centrifugation. The first tested technique was performed as follows: the mononuclear cells were incubated with the S-protein of the SARS-CoV-2 virus, and stained with fluorescently labeled antibodies. The percentage of CD8highCD107a was counted by means of BD FACS Canto II flow cytometer. When assessed by the ELISpot method with “Human IFN-γ ELISpot” kit, IFNγ production was stimulated by SARS-CoV-2 S-protein, or a mixture of SARS-CoV-2 protein peptides in the “Corona-T-test” kit. There were no significant differences in the levels of CD107a expression on CD8high cells between the groups 1, 2, 3, and 4, as well as in amounts of IFNγ producers against SARS-CoV-2 S-protein when using “Human IFN-γ ELISpot” kit. Production of IFN was  significantly  lower  in  group  3  (hybrid  immunity), i.e., 317.29±19.04 pg/ml compared to groups 1 and 2 (post-infection and post-vaccination immunity), i.e., 454.95±20.32 and 470.77±26.24 pg /ml, respectively. The relative level of IFNγ -producing cells in group 2 was higher (22.34±3.77) versus 16.83±2.35 in group 1, and 15.46±1.83 in group 3, whereas the relative levels of IFNγ did not differ in these groups. Stimulation with full-length S-protein showed a significant reduction in the number of spots in group 4 (breakthrough immunity), i.e., 30.59±2.29 vs 58.97±4.47 in group 3. Stimulation with a mixture of SARS-CoV-2 peptides in group 4 vs group 3 revealed a significantly increased number of IFNγ -producing cells (86.72±7.20 versus 69.38±5.53) and higher IFNγ production (991.25±65.18 pg/ml versus 760.76±50.70 pg/ml). Appropriate relative values were as follows: 10.30±2.77 versus 8.61±2.66, and 68.10±9.41 versus 48.35±8.15, respectively. The results of three methods for evaluation of cellular immune response correlate positively with each other, but at different significance levels.

клеточный иммунитетSARS-CoV-2гибридный иммунитетпрорывной иммунитетELISpotцитотоксические лимфоцитыCD8+cellular immunitySARS-CoV-2hybrid immunitybreakthrough immunityELISpotcytotoxic lymphocytesCD8+ cellsРазработка используемого в исследовании набора реагентов для определения Т-клеточного ответа на SARS-CoV-2 Corona-T-test была осуществлена при финансовой поддержке гранта Российского Научного Фонда № 20-15-00395.ReferencesПотеряев Д.А., Аббасова С.Г., Игнатьева П.Е., Стрижакова О.М., Колесник С.В., Хамитов Р.А. Оценка Т-клеточного иммунитета к SARS-CoV-2 у переболевших и вакцинированных против COVID-19 лиц с помощью ELISPOT набора ТиграТест® SARS-CoV-2 // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение, 2021. Т. 21, № 3. С. 178-192.Poteryaev D.A., Abbasova S.G., Ignatieva P.E., Strizhakova O.M., Kolesnik S.V., Khamitov R.A. Evaluation of T-cell immunity to SARS-CoV-2 in recovered patients and vaccinated against COVID-19 using the TigraTest® SARS-CoV-2 ELISPOT kit. BIOpreparaty. Profilaktika, Diagnostika, Lecheniye = BIOpreparations. Prevention, Diagnosis, Treatment, 2021, Vol. 21, no. 3, pp. 178-192. (In Russ.)Смердова М.А., Топтыгина А.П., Андреев Ю.Ю., Сенникова С.В., Зеткин А.Ю., Клыкова Т.Г., Беляков С.И. Гуморальный и клеточный иммунитет к антигенам вирусов кори и краснухи у здоровых людей // Инфекция и иммунитет, 2019. Т. 9, № 3-4. С. 607-611. doi: 10.15789/2220-7619-2019-3-4-607-611.Smerdova M.A., Toptygina A.P., Andreev Yu.Yu., Sennikova S.V., Zetkin A.Yu., Klykova T.G., Belyakov S.I. Humoral and cellular immunity to measles and rubella virus antigens in healthy subjects. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2019, Vol. 9, no. 3-4, pp. 607-611. (In Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-2019-3-4-607-611.Топтыгина А.П., Семикина Е.Л., Алешкин В.А. Формирование и поддержание специфического клеточного ответа на вакцинацию «Приорикс» // Иммунология, 2013. Т. 34, № 5. С. 257-261.Toptygina A.P., Semikina E.L., Alioshkin V.A. The shaping and the maintenance of T-cell specific immune response to vaccination Priorix. Immunologiya = Immunologiya, 2013, Vol. 34, no. 5, pp. 257-261. (In Russ.)Топтыгина А.П., Семикина Е.Л., Закиров Р.Ш., Афридонова З.Э. Сопоставление гуморального и клеточного иммунитета у переболевших COVID-19 // Инфекция и иммунитет, 2022. Т. 12, № 3. С.495-504. doi: 10.15789/2220-7619-COT-1809.Toptygina A.P., Semikina E.L., Zakirov R.Sh., Afridonova Z.E. Comparison of the humoral and cellular immunity in COVID-19 convalescents. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2022, Vol. 12, no. 3, pp. 495-504. (In Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-COT-1809.Aktas E., Kucuksezer U.C., Bilgic S., Erten G., Deniz G. Relationship between CD107a expression and cytotoxic activity. Cell Immunol., 2009, Vol. 254, no. 2, pp. 149-154.Aktas E., Kucuksezer U.C., Bilgic S., Erten G., Deniz G. Relationship between CD107a expression and cytotoxic activity. Cell Immunol., 2009, Vol. 254, no. 2, pp. 149-154.Beňová K., Hancková M., Koči K., Kúdelová M., Betáková T. T cells and their function in the immune response to viruses. Acta Virol., 2020, Vol. 64, no. 2, pp. 131-143.Beňová K., Hancková M., Koči K., Kúdelová M., Betáková T. T cells and their function in the immune response to viruses. Acta Virol., 2020, Vol. 64, no. 2, pp. 131-143.Betts M.R., Brenchley J.M., Price D.A., de Rosa S.C., Douek D.C., Roederer M., Koup R.A. Sensitive and viable identification of antigen-specific CD8+ T cells by a flow cytometric assay for degranulation. J. Immunol. Methods, 2003, Vol. 281, no. 1-2, pp. 65-78.Betts M.R., Brenchley J.M., Price D.A., de Rosa S.C., Douek D.C., Roederer M., Koup R.A. Sensitive and viable identification of antigen-specific CD8+ T cells by a flow cytometric assay for degranulation. J. Immunol. Methods, 2003, Vol. 281, no. 1-2, pp. 65-78.Bouwman W., Verhaegh W., Holtzer L., van de Stolpe A. Measurement of cellular immune response to viral infection and vaccination. Front. Immunol., 2020, Vol. 11, 575074. doi: 10.3389/fimmu.2020.575074.Bouwman W., Verhaegh W., Holtzer L., van de Stolpe A. Measurement of cellular immune response to viral infection and vaccination. Front. Immunol., 2020, Vol. 11, 575074. doi: 10.3389/fimmu.2020.575074.Braun J., Loyal L., Frentsch M., Wendisch D., Georg P., Kurth F., Hippenstiel S., Dingeldey M., Kruse B., Fauchere F., Baysal E., Mangold M., Henze L., Lauster R., Mall M.A., Beyer K., Röhmel J., Voigt S., Schmitz J., Miltenyi S., Demuth I., Müller M.A., Hocke A., Witzenrath M., Suttorp N., Kern F., Reimer U., Wenschuh H., Drosten C., Corman V.M., Giesecke-Thiel C., Sander L.E., Thiel A. SARS-CoV-2-reactive T cells in healthy donors and patients with COVID-19. Nature, 2020, Vol. 587, no. 7833, pp. 270-274.Braun J., Loyal L., Frentsch M., Wendisch D., Georg P., Kurth F., Hippenstiel S., Dingeldey M., Kruse B., Fauchere F., Baysal E., Mangold M., Henze L., Lauster R., Mall M.A., Beyer K., Röhmel J., Voigt S., Schmitz J., Miltenyi S., Demuth I., Müller M.A., Hocke A., Witzenrath M., Suttorp N., Kern F., Reimer U., Wenschuh H., Drosten C., Corman V.M., Giesecke-Thiel C., Sander L.E., Thiel A. SARS-CoV-2-reactive T cells in healthy donors and patients with COVID-19. Nature, 2020, Vol. 587, no. 7833, pp. 270-274.García L.F. Immune Response, Inflammation, and the Clinical Spectrum of COVID-19. Front. Immunol., 2020, Vol. 11, 1441. doi: 10.3389/fimmu.2020.01441.García L.F. Immune Response, Inflammation, and the Clinical Spectrum of COVID-19. Front. Immunol., 2020, Vol. 11, 1441. doi: 10.3389/fimmu.2020.01441.Gupta S., Agrawal S., Sandoval A., Su H., Tran M., Demirdag Y. SARS-CoV-2-specific and functional cytotoxic CD8 cells in primary antibody deficiency: Natural infection and response to vaccine. J. Clin. Immunol., 2022, Vol. 42, no. 5, pp. 914-922.Gupta S., Agrawal S., Sandoval A., Su H., Tran M., Demirdag Y. SARS-CoV-2-specific and functional cytotoxic CD8 cells in primary antibody deficiency: Natural infection and response to vaccine. J. Clin. Immunol., 2022, Vol. 42, no. 5, pp. 914-922.Keshavarz M., Shafiee A., Nicknam M.H., Khosravani P., Yousefi A., Izad M. Immune response to the mumps virus in iranian unvaccinated young adults. Japan J. Infect. Dis., 2017, Vol. 70, no. 2, pp. 127-131.Keshavarz M., Shafiee A., Nicknam M.H., Khosravani P., Yousefi A., Izad M. Immune response to the mumps virus in iranian unvaccinated young adults. Japan J. Infect. Dis., 2017, Vol. 70, no. 2, pp. 127-131.Kundura L., Cezar R., André S., Campos-Mora M., Lozano C., Vincent T., Muller L., Lefrant J.Y., Roger C., Claret P.G., Duvnjak S., Loubet P., Sotto A., Tran T.A., Estaquier J., Corbeau P. Low perforin expression in CD8+ T lymphocytes during the acute phase of severe SARS-CoV-2 infection predicts long COVID. Front. Immunol., 2022, Vol. 13, 1029006. doi: 10.3389/fimmu.2022.1029006.Kundura L., Cezar R., André S., Campos-Mora M., Lozano C., Vincent T., Muller L., Lefrant J.Y., Roger C., Claret P.G., Duvnjak S., Loubet P., Sotto A., Tran T.A., Estaquier J., Corbeau P. Low perforin expression in CD8+ T lymphocytes during the acute phase of severe SARS-CoV-2 infection predicts long COVID. Front. Immunol., 2022, Vol. 13, 1029006. doi: 10.3389/fimmu.2022.1029006.Le Bert N., Clapham H.E., Tan A.T., Chia W.N., Tham C.Y.L., Lim J.M., Kunasegaran K., Tan L.W.L., Dutertre C.A., Shankar N., Lim J.M.E., Sun L.J., Zahari M., Tun Z.M., Kumar V., Lim B.L., Lim S.H., Chia A., Tan Y.J., Tambyah P.A., Kalimuddin S., Lye D., Low J.G.H., Wang L.F., Wan W.Y., Hsu L.Y., Bertoletti A., Tam C.C. Highly functional virus-specific cellular immune response in asymptomatic SARS-CoV-2 infection. J. Exp. Med., 2021, Vol. 218, no. 5, e20202617. doi: 10.1084/jem.20202617.Le Bert N., Clapham H.E., Tan A.T., Chia W.N., Tham C.Y.L., Lim J.M., Kunasegaran K., Tan L.W.L., Dutertre C.A., Shankar N., Lim J.M.E., Sun L.J., Zahari M., Tun Z.M., Kumar V., Lim B.L., Lim S.H., Chia A., Tan Y.J., Tambyah P.A., Kalimuddin S., Lye D., Low J.G.H., Wang L.F., Wan W.Y., Hsu L.Y., Bertoletti A., Tam C.C. Highly functional virus-specific cellular immune response in asymptomatic SARS-CoV-2 infection. J. Exp. Med., 2021, Vol. 218, no. 5, e20202617. doi: 10.1084/jem.20202617.Lind Enoksson S., Bergman P., Klingström J., Boström F., da Silva Rodrigues R., Winerdal M.E., Marits P. A flow cytometry-based proliferation assay for clinical evaluation of T-cell memory against SARS-CoV-2. J. Immunol. Methods, 2021, Vol. 499, 113159. doi: 10.1016/j.jim.2021.113159.Lind Enoksson S., Bergman P., Klingström J., Boström F., da Silva Rodrigues R., Winerdal M.E., Marits P. A flow cytometry-based proliferation assay for clinical evaluation of T-cell memory against SARS-CoV-2. J. Immunol. Methods, 2021, Vol. 499, 113159. doi: 10.1016/j.jim.2021.113159.Moss P. The T cell immune response against SARS-CoV-2. Nat. Immunol., 2022, Vol. 23, no. 2, pp. 186-193.Moss P. The T cell immune response against SARS-CoV-2. Nat. Immunol., 2022, Vol. 23, no. 2, pp. 186-193.Paolini A., Borella R., Neroni A., Lo Tartaro D., Mattioli M., Fidanza L., di Nella A., Santacroce E., Gozzi L., Busani S., Trenti T., Meschiari M., Guaraldi G., Girardis M., Mussini C., Gibellini L., de Biasi S., Cossarizza A. Patients recovering from severe COVID-19 develop a polyfunctional antigen-specific CD4+ T cell response. Int. J. Mol. Sci., 2022, Vol. 23, no. 14, 8004. doi: 10.3390/ijms23148004.Paolini A., Borella R., Neroni A., Lo Tartaro D., Mattioli M., Fidanza L., di Nella A., Santacroce E., Gozzi L., Busani S., Trenti T., Meschiari M., Guaraldi G., Girardis M., Mussini C., Gibellini L., de Biasi S., Cossarizza A. Patients recovering from severe COVID-19 develop a polyfunctional antigen-specific CD4+ T cell response. Int. J. Mol. Sci., 2022, Vol. 23, no. 14, 8004. doi: 10.3390/ijms23148004.Phillips E., Adele S., Malone T., Deeks A., Stafford L., Dobson S.L., Amini A., Skelly D., Eyre D., Jeffery K., Conlon C.P., Dold C., Otter A., d’Arcangelo S., Turtle L.; PITCH Consortium, Klenerman P., Barnes E., Dunachie S.J. Comparison of two T-cell assays to evaluate T-cell responses to SARS-CoV-2 following vaccination in naïve and convalescent healthcare workers. Clin. Exp. Immunol., 2022, Vol. 209, no. 1, pp. 90-98.Phillips E., Adele S., Malone T., Deeks A., Stafford L., Dobson S.L., Amini A., Skelly D., Eyre D., Jeffery K., Conlon C.P., Dold C., Otter A., d’Arcangelo S., Turtle L.; PITCH Consortium, Klenerman P., Barnes E., Dunachie S.J. Comparison of two T-cell assays to evaluate T-cell responses to SARS-CoV-2 following vaccination in naïve and convalescent healthcare workers. Clin. Exp. Immunol., 2022, Vol. 209, no. 1, pp. 90-98.Ranieri E., Netti G.S., Gigante M. CTL ELISPOT Assay and T Cell Detection. Methods Mol. Biol., 2021, Vol. 2325, pp. 65-67.Ranieri E., Netti G.S., Gigante M. CTL ELISPOT Assay and T Cell Detection. Methods Mol. Biol., 2021, Vol. 2325, pp. 65-67.Ruan Y., Guo W., Liang S., Xu Z., Niu T. Diagnostic performance of cytomegalovirus (CMV) immune monitoring with ELISPOT and QuantiFERON-CMV assay in kidney transplantation: A PRISMA-compliant article. Medicine (Baltimore), 2019, Vol. 98, no. 16, e15228. doi: 10.1097/MD.0000000000015228.Ruan Y., Guo W., Liang S., Xu Z., Niu T. Diagnostic performance of cytomegalovirus (CMV) immune monitoring with ELISPOT and QuantiFERON-CMV assay in kidney transplantation: A PRISMA-compliant article. Medicine (Baltimore), 2019, Vol. 98, no. 16, e15228. doi: 10.1097/MD.0000000000015228.Schoenborn J.R., Wilson C.B. Regulation of interferon-gamma during innate and adaptive immune responses. Adv. Immunol., 2007, Vol. 96, pp. 41-101.Schoenborn J.R., Wilson C.B. Regulation of interferon-gamma during innate and adaptive immune responses. Adv. Immunol., 2007, Vol. 96, pp. 41-101.Sekine T., Perez-Potti A., Rivera-Ballesteros O., Strålin K., Gorin J.B., Olsson A., Llewellyn-Lacey S., Kamal H., Bogdanovic G., Muschiol S., Wullimann D.J., Kammann T., Emgård J., Parrot T., Folkesson E; Karolinska COVID-19 Study Group, Rooyackers O., Eriksson L.I., Henter J.I., Sönnerborg A., Allander T., Albert J., Nielsen M., Klingström J., Gredmark-Russ S., Björkström N.K., Sandberg J.K., Price D.A., Ljunggren H.G., Aleman S., Buggert M. Robust T Cell Immunity in Convalescent Individuals with Asymptomatic or Mild COVID-19. Cell, 2020, Vol. 183, no. 1, pp.158-168.Sekine T., Perez-Potti A., Rivera-Ballesteros O., Strålin K., Gorin J.B., Olsson A., Llewellyn-Lacey S., Kamal H., Bogdanovic G., Muschiol S., Wullimann D.J., Kammann T., Emgård J., Parrot T., Folkesson E; Karolinska COVID-19 Study Group, Rooyackers O., Eriksson L.I., Henter J.I., Sönnerborg A., Allander T., Albert J., Nielsen M., Klingström J., Gredmark-Russ S., Björkström N.K., Sandberg J.K., Price D.A., Ljunggren H.G., Aleman S., Buggert M. Robust T Cell Immunity in Convalescent Individuals with Asymptomatic or Mild COVID-19. Cell, 2020, Vol. 183, no. 1, pp.158-168.Shomuradova A.S., Vagida M.S., Sheetikov S.A., Zornikova K.V., Kiryukhin D., Titov A., Peshkova Iu.O., Khmelevskaya A., Dianov D.V., Malasheva M., Shmelev A., Serdyuk Ya., Bagaev D.V., Pivnyuk A., Shcherbinin D.S., Maleeva A.V., Shakirova N.T., Pilunov A., Malko D.B., Khamaganova E.G., Biderman B., Ivanov A., Shugay M., Efimov G.A. SARS-CoV-2 Epitopes Are Recognized by a Public and Diverse Repertoire of Human T Cell Receptors. Immunity, 2020, Vol. 53, pp. 1245-1257.Shomuradova A.S., Vagida M.S., Sheetikov S.A., Zornikova K.V., Kiryukhin D., Titov A., Peshkova Iu.O., Khmelevskaya A., Dianov D.V., Malasheva M., Shmelev A., Serdyuk Ya., Bagaev D.V., Pivnyuk A., Shcherbinin D.S., Maleeva A.V., Shakirova N.T., Pilunov A., Malko D.B., Khamaganova E.G., Biderman B., Ivanov A., Shugay M., Efimov G.A. SARS-CoV-2 Epitopes Are Recognized by a Public and Diverse Repertoire of Human T Cell Receptors. Immunity, 2020, Vol. 53, pp. 1245-1257.Tarke A., Sidney J., Kidd C.K., Dan J.M., Ramirez S.I., Yu E.D., Mateus J., da Silva Antunes R., Moore E., Rubiro P., Methot N., Phillips E., Mallal S., Frazier A., Rawlings S.A., Greenbaum J.A., Peters B., Smith D.M., Crotty S., Weiskopf D., Grifoni A., Sette A. Comprehensive analysis of T cell immunodominance and immunoprevalence of SARS-CoV-2 epitopes in COVID-19 cases. Cell Rep. Med., 2021, Vol. 2, no. 2, 100204. doi: 10.1016/j.xcrm.2021.100204.Tarke A., Sidney J., Kidd C.K., Dan J.M., Ramirez S.I., Yu E.D., Mateus J., da Silva Antunes R., Moore E., Rubiro P., Methot N., Phillips E., Mallal S., Frazier A., Rawlings S.A., Greenbaum J.A., Peters B., Smith D.M., Crotty S., Weiskopf D., Grifoni A., Sette A. Comprehensive analysis of T cell immunodominance and immunoprevalence of SARS-CoV-2 epitopes in COVID-19 cases. Cell Rep. Med., 2021, Vol. 2, no. 2, 100204. doi: 10.1016/j.xcrm.2021.100204.Titov A., Shaykhutdinova R., Shcherbakova O.V., Serdyuk Y.V., Sheetikov S.A., Zornikova K.V., Maleeva A.V., Khmelevskaya A., Dianov D.V., Shakirova N.T., Malko D.B., Shkurnikov M., Nersisyan S., Tonevitsky A., Khamaganova E., Ershov A.V., Osipova E.Y., Nikolaev R.V., Pershin D.E., Vedmedskia V.A., Maschan M., Ginanova V.R., Efimov G.A. Immunogenic epitope panel for accurate detection of non-cross-reactive T cell response to SARS-CoV-2. JCI Insight, 2022, Vol. 7, no. 9, e157699. doi: 10.1172/jci.insight.157699.Titov A., Shaykhutdinova R., Shcherbakova O.V., Serdyuk Y.V., Sheetikov S.A., Zornikova K.V., Maleeva A.V., Khmelevskaya A., Dianov D.V., Shakirova N.T., Malko D.B., Shkurnikov M., Nersisyan S., Tonevitsky A., Khamaganova E., Ershov A.V., Osipova E.Y., Nikolaev R.V., Pershin D.E., Vedmedskia V.A., Maschan M., Ginanova V.R., Efimov G.A. Immunogenic epitope panel for accurate detection of non-cross-reactive T cell response to SARS-CoV-2. JCI Insight, 2022, Vol. 7, no. 9, e157699. doi: 10.1172/jci.insight.157699.Villemonteix J., Cohen L., Guihot A., Guérin V., Moulin C., Caseris M., Carol A., Bonacorsi S., Carcelain G. Comparison between enzyme-linked immunospot assay and intracellular cytokine flow cytometry assays for the evaluation of T cell response to SARS-CoV-2 after symptomatic COVID-19. Immun. Inflamm. Dis., 2022, Vol. 10, no. 10, e617. doi: 10.1002/iid3.617.Villemonteix J., Cohen L., Guihot A., Guérin V., Moulin C., Caseris M., Carol A., Bonacorsi S., Carcelain G. Comparison between enzyme-linked immunospot assay and intracellular cytokine flow cytometry assays for the evaluation of T cell response to SARS-CoV-2 after symptomatic COVID-19. Immun. Inflamm. Dis., 2022, Vol. 10, no. 10, e617. doi: 10.1002/iid3.617.Wherry E.J., Masopust D. Adaptive immunity: neutralizing, eliminating, and remembering for the next time. Viral pathogenesis (Third Edition), From Basics to Systems Biology, 2016, pp. 57-69.Wherry E.J., Masopust D. Adaptive immunity: neutralizing, eliminating, and remembering for the next time. Viral pathogenesis (Third Edition), From Basics to Systems Biology, 2016, pp. 57-69.Zajac A.J., Harrington L.E., Immune Response to Viruses: Cell-Mediated Immunity. Encyclopedia of Virology, Elsevier eBooks, 2008, pp. 70-77.Zajac A.J., Harrington L.E., Immune Response to Viruses: Cell-Mediated Immunity. Encyclopedia of Virology, Elsevier eBooks, 2008, pp. 70-77.Zornikova K.V., Khmelevskaya A., Sheetikov S.A., Kiryukhin D.O., Shcherbakova O.V., Titov A., Zvyagin I.V., Efimov G.A. Clonal diversity predicts persistence of SARS-CoV-2 epitope-specific T-cell response. Commun. Biol., 2022, Vol. 5, no. 1, 1351. doi: 10.1038/s42003-022-04250-7.Zornikova K.V., Khmelevskaya A., Sheetikov S.A., Kiryukhin D.O., Shcherbakova O.V., Titov A., Zvyagin I.V., Efimov G.A. Clonal diversity predicts persistence of SARS-CoV-2 epitope-specific T-cell response. Commun. Biol., 2022, Vol. 5, no. 1, 1351. doi: 10.1038/s42003-022-04250-7.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.