mimmunМедицинская иммунологияMedical Immunology (Russia)1563-06252313-741XSPb RAACI10.15789/1563-0625-2019-5-959-964mimmun-1615Research ArticleКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯSHORT COMMUNICATIONSРАСПРЕДЕЛЕНИЕ АЛЛЕЛЕЙ MICA В РОССИЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИDISTRIBUTION OF MICA ALLELES IN THE RUSSIAN POPULATIONКаневскийЛ. М.KanevskiyL. M.

Каневский Леонид Михайлович, к.б.н., научный сотрудник 

117997, Россия, Москва, ГСП-7, ул. Миклухо-Маклая, 16/10.

Тел.: 8 (917) 552-27-22. Факс: 8 (495) 335-08-12.

Kanevskiy Leonid M., PhD (Biology), Research Associate

117997, Russian Federation, Moscow, GSP-7, Miklukho-Maklai str., 16/10.

Phone: 7 (917) 552-27-22. Fax: 7 (495) 335-08-12.

leonid_kanewski@mail.ruГречихинаМ. В.GrechikhinaM. V.

младший научный сотрудник

г. Москва

Junior Research Associate

Moscow

marygrec@mail.ruКузьминаЕ. Г.KuzminaE. G.

к.б.н., доцент, заведующая лабораторией клинической иммунологии

PhD (Biology), Associate Professor, Head, Clinical Immunology Laboratory

Obninsk

kuzmina_e_g@mail.ruМушкаринаТ. Ю.MushkarinaT. Yu.

научный сотрудник лаборатории клинической иммунологии

г. Обнинск

Research Associate, Clinical Immunology Laboratory

Obninsk

jeweltany@gmail.comСпелковА. А.SpelkovA. A.

студент 

г. Москва

Student

Moscow

alex_spelkov95@mail.ruСтрельцоваМ. А.StreltsovaM. A.

младший научный сотрудник

г. Москва

Junior Research Associate

Moscow

mstreltsova@mail.ruКоваленкоЕ. И.KovalenkoE. I.

к.б.н., старший научный сотрудник

г. Москва

PhD (Biology), Senior Research Associate

Moscow

lenkovalen@mail.ruФГБУН «Институт биоорганической химии имени академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова» Российской академии наукРоссияShemyakin–Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of SciencesRussian FederationМедицинский радиологический научный центр имени А.Ф. Цыба – филиал ФГБУ «Научный медицинский исследовательский центр радиологии» Министерства здравоохранения РФРоссияA. Tsyb Medical Radiological Research Center – Branch of National Medical Research Radiological CenterRussian Federation201911032019215959964Copyright © Каневский Л.М., Гречихина М.В., Кузьмина Е.Г., Мушкарина Т.Ю., Спелков А.А., Стрельцова М.А., Коваленко Е.И., 20192019Каневский Л.М., Гречихина М.В., Кузьмина Е.Г., Мушкарина Т.Ю., Спелков А.А., Стрельцова М.А., Коваленко Е.И.Kanevskiy L.M., Grechikhina M.V., Kuzmina E.G., Mushkarina T.Y., Spelkov A.A., Streltsova M.A., Kovalenko E.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/2019-21-5-10

Под влиянием стрессовых факторов, инфекций, опухолевой трансформации на поверхности клеток организма экспрессируется белок MICA, который является лигандом к рецептору NKG2D NK- и Т-клеток. Взаимодействие рецептора NKG2D на поверхности клеток иммунной системы с MICA приводит к активации лимфоцитов и уничтожению носителя лиганда. Ген MICA отличается высоким уровнем полиморфизма. К настоящему времени описано 87 аллелей, продукты которых различаются по способности активировать цитотоксические лимфоциты, что может оказывать влияние на протекание ряда заболеваний, таких как рак, вирусные инфекции, аутоиммунные заболевания. Распределения аллелей MICA в разных этносах существенно различаются. Анализ полиморфизма MICA в данном этносе необходим для выявления взаимосвязей между определенными аллелями MICA и теми или иными заболеваниями. Данная работа направлена на исследование распределения аллелей MICA среди населения России.

Типирование MICA проводили по методике, предложенной Yizhou Zoe и Peter Stastny. Методика включала в себя: 1) выделение геномной ДНК из цельной донорской крови; 2) ПЦР с целью амплификации фрагмента гена MICA; 3) секвенирование полученных ПЦР-фрагментов. Анализ результатов секвенирования проводили с использованием программ Vector NTI и Chromas Lite.

Был определен генотип аллелей MICA 119 доноров. Из 87 описанных в литературе аллелей MICA среди исследованных образцов обнаружено 15. Частоты встречаемости аллелей MICA оказались следующими: *002 – 19,3%, *004 – 6,7%, *007 – 3,0%, *008 – 35,7%, *009 – 10,1%, *010 – 5,0%, *011 – 3,8%, *012 – 2,1%, *016 – 2,5%, *017 – 3,4%, *018 – 5,5%, *019 – 0,4%, *027 – 1,3%, *053 – 0,8%, *068 – 0,4%. Выяснилось, что распределение аллелей MICA в России сходно с таковыми для европейских стран. При сопоставлении литературных данных по разным странам мира выяснилось, что различия в распределении аллелей MICA выражены преимущественно между расами, а не нациями.

В данной работе проанализировано распределение аллелей MICA у россиян. Оно оказалось весьма сходным с таковыми у представителей других европейских стран и имеет ряд существенных отличий от этносов монголоидной расы (Япония, Китай, Корея). Анализ распределения аллелей MICA в российской популяции может оказаться полезен для выявления предрасположенности индивидов к тем или иным заболеваниям.

Stress factors, infections, tumor transformation of the cells of organism induce the expression of MICA protein, which is a ligand for the NKG2D receptor of NK and T cells. The interaction of the NKG2D receptor on the surface of the cells of the immune system with MICA results in activation of lymphocytes and elimination of the ligand carrier. The MICA gene has a high level of polymorphism. To date, 87 alleles have been described; their products differ in ability to activate cytotoxic lymphocytes, that can affect the progression of a number of diseases, such as cancer, viral infections, autoimmune diseases. The distribution of MICA alleles in different ethnic groups varies considerably. The analysis of MICA polymorphism in a current ethnos is necessary for revealing the relationships between certain MICA alleles and different diseases. Goal. This work is aimed at studying of the distribution of MICA alleles in Russian population. Materials and methods. Polymorphism of MICA was analyzed according to the procedure proposed by Yizhou Zoe and Peter Stastny. The procedure included: 1) isolation of genomic DNA from whole blood; 2) PCR for amplification of a fragment of the MICA gene; 3) sequencing of the resulting PCR fragments. Analysis of the results of sequencing was carried out using the programs Vector NTI and Chromas Lite. Results. The genotype of the MICA alleles of 119 donors has been determined. Of the 87 MICA alleles described in the literature, 15 were found among the samples studied. The frequencies of MICA alleles were the following: *002 – 19.3%, *004 – 6.7%, *007 – 3.0%, *008 – 35.7%, *009 – 10.1%, *010 – 5.0%, *011 – 3.8%, *012 – 2.1%, *016 – 2.5%, *017 – 3.4% *018 – 5.5%, *019 – 0.4%, *027 – 1.3%, *053 – 0.8%, *068 – 0.4%. The distribution of MICA alleles in Russia was found to be similar to that of European countries. When comparing literary data for different countries of the world, it was found that the differences in the distribution of MICA alleles are expressed mainly between races, and not nations. Conclusions. In this paper, the distribution of MICA alleles in Russian population has been analyzed. It turned out to be very similar to those of other European countries and has a number of significant differences from the ethnoses of the Mongoloid race (Japan, China, Korea). The analysis of the distribution of MICA alleles in the Russian population may be useful for identifying the predisposition of individuals to certain diseases.

MHCMICANKG2Dгенотипированиесеквенированиепопуляционный анализMHCMICANKG2Dgenotypingsequencingpopulation analysisРабота выполнена при поддержке РФФИ, грант № 16-04-01867.ReferencesChen D., Gyllensten U. MICA polymorphism: biology and importance in cancer. Carcinogenesis, 2014, Vol. 35, no. 12, pp. 2633-2642.Chen D., Gyllensten U. MICA polymorphism: biology and importance in cancer. Carcinogenesis, 2014, Vol. 35, no. 12, pp. 2633-2642.Ďurmanová V., Tirpakova J., Stuchlikova M., Shawkatova I., Kuba D., Sapak M., Buc M. Characterization of MICA gene polymorphism of HLA complex in the Slovak population. Ann. Hum. Biol., 2011, Vol. 38, no. 5, pp. 570-576.Ďurmanová V., Tirpakova J., Stuchlikova M., Shawkatova I., Kuba D., Sapak M., Buc M. Characterization of MICA gene polymorphism of HLA complex in the Slovak population. Ann. Hum. Biol., 2011, Vol. 38, no. 5, pp. 570-576.Fürst D., Solgi G., Recker K., Mytilineos D., Schrezenmeier H., Mytilineos J. Sequence-based typing of major histocompatibility complex class I chain-related gene A alleles by use of exons 2-5 information. Tissue Antigens, 2011, Vol. 77, no. 3, pp. 201-205.Fürst D., Solgi G., Recker K., Mytilineos D., Schrezenmeier H., Mytilineos J. Sequence-based typing of major histocompatibility complex class I chain-related gene A alleles by use of exons 2-5 information. Tissue Antigens, 2011, Vol. 77, no. 3, pp. 201-205.González S., Groh V., Spies T. Immunobiology of human NKG2D and its ligands. Curr. Top. Microbiol. Immunol., 2006, Vol. 298, pp. 121-138.González S., Groh V., Spies T. Immunobiology of human NKG2D and its ligands. Curr. Top. Microbiol. Immunol., 2006, Vol. 298, pp. 121-138.Guo S.W., Thompson E.A. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles. Biometrics, 1992, Vol. 48, no. 2, pp. 361-372.Guo S.W., Thompson E.A. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles. Biometrics, 1992, Vol. 48, no. 2, pp. 361-372.Komatsu-Wakui M., Tokunaga K., Ishikawa Y., Kashiwase K., Moriyama S., Tsuchiya N., Ando H., Shiina T., Geraghty D.E., Inoko H., Juji T. MIC-A polymorphism in Japanese and a MIC-A-MIC-B null haplotype. Immunogenetics, 1999, Vol. 49, no. 7-8, pp. 620-628.Komatsu-Wakui M., Tokunaga K., Ishikawa Y., Kashiwase K., Moriyama S., Tsuchiya N., Ando H., Shiina T., Geraghty D.E., Inoko H., Juji T. MIC-A polymorphism in Japanese and a MIC-A-MIC-B null haplotype. Immunogenetics, 1999, Vol. 49, no. 7-8, pp. 620-628.Molinero L.L., Marcos C.Y., Mirbaha F., Fainboim L., Stastny P., Zwirner N.W. Codominant expression of the polymorphic MICA alloantigens encoded by genes in the HLA region. Eur. J. Immunogenet. Off. J. Br. Soc. Histocompat. Immunogenet., 2002, Vol. 29, no. 4, pp. 315-319.Molinero L.L., Marcos C.Y., Mirbaha F., Fainboim L., Stastny P., Zwirner N.W. Codominant expression of the polymorphic MICA alloantigens encoded by genes in the HLA region. Eur. J. Immunogenet. Off. J. Br. Soc. Histocompat. Immunogenet., 2002, Vol. 29, no. 4, pp. 315-319.Pyo C.W., Hur S.S., Kim Y.K., Choi H.B., Kim T.Y., Kim T.G. Distribution of MICA alleles and haplotypes associated with HLA in the Korean population. Hum. Immunol., 2003, Vol. 64, no. 3, pp. 378-384.Pyo C.W., Hur S.S., Kim Y.K., Choi H.B., Kim T.Y., Kim T.G. Distribution of MICA alleles and haplotypes associated with HLA in the Korean population. Hum. Immunol., 2003, Vol. 64, no. 3, pp. 378-384.Tian W., Cai J.H., Wang F., Li L.X. MICA polymorphism in a northern Chinese Han population: the identification of a new MICA allele, MICA*059. Hum Immunol., 2010, Vol. 71, no. 4, pp. 423-427.Tian W., Cai J.H., Wang F., Li L.X. MICA polymorphism in a northern Chinese Han population: the identification of a new MICA allele, MICA*059. Hum Immunol., 2010, Vol. 71, no. 4, pp. 423-427.Wenda S., Faé I., Sanchez-Mazas A., Nunes J.M., Mayr W.R., Fischer G.F. The distribution of MICA alleles in an Austrian population: Evidence for increasing polymorphism. Hum. Immunol., 2013, Vol. 74, no. 10, pp. 1295-1299.Wenda S., Faé I., Sanchez-Mazas A., Nunes J.M., Mayr W.R., Fischer G.F. The distribution of MICA alleles in an Austrian population: Evidence for increasing polymorphism. Hum. Immunol., 2013, Vol. 74, no. 10, pp. 1295-1299.Zou Y., Stastny P. High resolution MICA genotyping by sequence-based typing (SBT). Methods Mol. Biol., 2012, Vol. 882, pp. 183-195.Zou Y., Stastny P. High resolution MICA genotyping by sequence-based typing (SBT). Methods Mol. Biol., 2012, Vol. 882, pp. 183-195.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.